Muzeum zostało zorganizowane w rodzinnym domu pisarki, zwanym niegdyś przez najbliższych Domem nad Łąkami. Nie była możliwa wierna rekonstrukcja wnętrz, dlatego koncepcja Muzeum zakłada oddanie atmosfery domu, z podkreśleniem postaci rodziców, szczególnie ojca, Wacława Nałkowskiego, będącego dla przyszłej pisarki wzorem moralnym, a także zaakcentowanie więzi Zofii z domem rodzinnym. Poszczególne pomieszczenia prezentują kolejne okresy życia i twórczości oraz działalności społecznej autorki Granicy. Oddają nastrój dzieciństwa i młodości Zofii Nałkowskiej, łącząc opowieść o epoce przełomu XIX i XXw. z historią lat późniejszych, łącznie z powojennymi. Eksponowane są pomieszczenia: salon, gabinet Wacława Nałkowskiego, ostatni pokój i pokój stołowy. Dom nad Łąkami ma już ponad 100 lat. Został zbudowany w połowie lat 90 XIXw. przez ojca pisarki wybitnego geografa i pedagoga, publicystę społecznego i krytyka literackiego